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2例单细胞悬液单细胞全序列转录组建库测序分析信息公示

发布时间:2023-10-19 点击数:

采购文件

第一章 项目信息

项目名称: 2例单细胞悬液单细胞全序列转录组建库测序分析

项目类型: □货物    ☑服务    □工程

采购方式:  询价

货币类型:  人民币

 

第二章 自行采购询价公告

根据《深圳大学总医院采购管理办法》的有关规定,深圳大学总医院就 2例单细胞悬液单细胞全序列转录组建库测序分析项目,进行公开询价,欢迎符合资格的供应商参加。

一、项目采购要求:

具体要求请下载附件《采购文件》。

 

二、投标人资质要求:

具有独立法人资格或具有独立承担民事责任的能力的其它组织(提供营业执照或事业单位法人证等法人证明扫描件,原件备查)。

 

三、采购预算或最高限价:

34054元(人民币)

 

四、提交资料要求:

(一)加盖供应商公章的报价单扫描件;

(二)加盖供应商公章的营业执照或事业单位法人证等法人证明扫描件;

(三)其他供应商认为需要提供的资料扫描件。

 

五、报名方式:

网上报名。将上述提交资料扫描件发送至邮箱:214665707@qq.com 

 

六、报名截止时间:

20231022日上午12:00。

 

七、联系人及联系方式

采购负责人 单位名称:深圳大学总医院 教学科研

联系人:  廖老师    电话:13410719058

 

第三章 项目需求

一、采购清单

①货物类须含:货物名称及型号、数量、关键技术指标、用途。

②服务类须含:服务内容、服务期限。

③工程类须含:工程范围及要求、工程量(可附工程量清单)。

单细胞全转录组

分析内容

备注

单样本分析

1.数据质控

 

2.有效Barcode统计,测序饱和度统计

 

3.基本数据分析,细胞数目统计,单个细胞reads数目统计等

 

4.基因表达定量,获得表达基因及其表达量数据

 

5.统计基因数、线粒体UMI占比

 

6.聚类分析,提供tSNE/UMAP聚类分析、PCA分析等

 

7.SingleR细胞类型自动注释(仅限人和小鼠)

 

8.marker基因分析,针对各cluster中差异高表达的特征性marker基因,以多种形式进行展示,包括Violin图形、在各cluster表达的图形展示

 

9.差异基因功能富集分析,包括GO和KEGG;Reactome(仅限于人和小鼠)

 

10、突变分析

 

多样本分析

1.多样本数据整合(利用Seurat V3/Harmony进行多样本整合分析)

 

2.去除批次效应

 

3.多样本质控可视化

 

4.聚类分析,提供tSNE/UMAP聚类分析、PCA分析等

 

5.细胞群之间的差异基因分析

 

6.多样本聚类分析,提供tSNE/UMAP聚类分析

 

7.多样本cluster占比图

 

8.多样本SingleR细胞类型自动注释(仅限人和小鼠)

 

9.差异基因功能富集,包括GO和KEGG;Reactome(仅限于人和小鼠)

 

10.不同分组细胞类型比较分析

 

11.不同分组差异分析

 

 

 

二、商务要求

(一)付款方式:到货2个月后付清100%货款

(二)关于交货/服务期限/工期要求:合同签订后1个月内

(三)关于验收:1、甲方在验收中,如果发现测序报告不合规定,应在15天内向乙方提出书面异议;乙方在接到书面异议后,应在7个工作日内负责处理。

2、甲乙双方应于到货后在双方有关人员监督下进行验收。

(四)关于违约:、乙方所交付测序报告不符合合同规定的,由乙方负责重新提供服务。

2、如果乙方没有按照合同规定的日期交货,除不可抗力之外,乙方应向甲方支付违约金,违约金不超过总价的5%。违约金比率为每周0.5%,不足7天以7天计。

 

 

 


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