单样本分析

1.数据质控

98000

50

2.有效Barcode统计，测序饱和度统计

3.基本数据分析，细胞数目统计，单个细胞reads数目统计等

4.基因表达定量，获得表达基因及其表达量数据

5.统计基因数、线粒体UMI占比

6.聚类分析，提供tSNE/UMAP聚类分析、PCA分析等

7.SingleR细胞类型自动注释（仅限人和小鼠）

8.marker基因分析，针对各cluster中差异高表达的特征性marker基因，以多种形式进行展示，包括Violin图形、在各cluster表达的图形展示

9.差异基因功能富集分析，包括GO和KEGG；Reactome（仅限于人和小鼠）

10、突变分析

多样本分析

1.多样本数据整合（利用Seurat V3/Harmony进行多样本整合分析）

2.去除批次效应

3.多样本质控可视化

4.聚类分析，提供tSNE/UMAP聚类分析、PCA分析等

5.细胞群之间的差异基因分析

6.多样本聚类分析，提供tSNE/UMAP聚类分析

7.多样本cluster占比图

8.多样本SingleR细胞类型自动注释（仅限人和小鼠）

9.差异基因功能富集，包括GO和KEGG；Reactome（仅限于人和小鼠）

10.不同分组细胞类型比较分析

11.不同分组差异分析